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张亚平
动物与人类遗传学 教授/院士, 博士导师
(Data Last updated Sept. 1, 2009)
云南大学生命科学学院生物资源保护与利用重点实验室
办公室/试验室:生物馆西楼 电话/传真:0871-5033362
学历
1986-1991 中国科学院昆明动物研究所,博士学位
学术任职及兼职
中国科学院院士,第三世界科学院院士,云南大学特聘教授
中国科学院昆明动物研究所所长 中国遗传学会副理事长
《Genome Biology and Evolution》副主编,《Animal Genetics》《科学通报》编委。
代表论文和著作
1. Yao Y.G, Kong QP, Bandelt HJ, Kivisild T, Zhang YP (2002) Am. J. Hum. Genet. 70: 635-651.
2. Savolainen P, Zhang YP, Luo J, Lundeberg J, Leitner T (2002) Science. 298: 1610-1613.
3. Kong QP, Yao YG, Sun C, Bandelt HJ, Zhu CL, Zhang YP (2003) Am. J. Hum. Genet. 73: 671-676.
4. Palanichamy MG, Sun C, Agrawal S, Bandelt HJ, Kong QP, Khan F, Wang CY, Chaudhuri TK, Palla V, Zhang YP (2004) Am. J. Hum. Genet. 75: 966-978.
5. Yu L and Zhang YP (2006) Mol Biol Evol 23: 2326-2335.
6. Wu GS, Yao YG, Qu KX, Ding ZL, Li H, Palanichamy MG, Duan ZY, Li N, Chen YS, Zhang YP (2007) Genome Biology 8: R245.
7. Wu DD, Irwin DM Zhang YP (2008) BMC Evolutionary Biology 8:241.
8. He F, Wu DD, Kong QP, Zhang YP (2008) PLoS One 3: e2948.
9. Xie HB, Irwin DM, Zhang YP (2008) BMC Genomics 9:520.
10. Wu DD, Wang GD, Irwin DM Zhang YP (2009) Mol Biol Evol. 26: 2333 - 2341
11. Li H, Wang CY, Wang JX, Wu GS, Yu P, Yan XY, Chen YG, Zhao LH, Zhang YP (2009) Eur J Hum Genet 17: 604-10.
12. Che J, Hu JS, Zhou WW, Murphy RW, Papenfuss TJ, Chen MY, Rao DQ, Li PP, Zhang YP (2009) Mol Phylogenet Evol 50: 59-73.
13. Shen Y, Shi P, Sun YB, Zhang YP (2009) Genome Res. 19: 1760-1765
14. Yu L , Wang XY et al (2009) Mol Biol Evol. doi:10.1093/molbev/msp216
获奖成果和名誉称号
国际奖
美国 “生物多样性领导奖”(Biodiversity Leadership Awards)。
国内奖
获何梁何利基金科学与技术进步奖,获云南省科学技术突出贡献奖,国家自然科学奖二等奖,长江学者成就奖等
主要研究兴趣
在基因组水平研究人类与动物的遗传与进化。近期主要包括:亚洲人群的基因多样性与进化;家养动物的起源与人工选择;进化基因组学;动物分子生态与保护遗传学;动物分子系统学
主要在研项目
973,国家基金重点,国家基金创新研究群体等重大项目
对招收研究生的要求
对研究有浓厚的兴趣,有理想,刻苦踏实
一、PI介绍
张亚平
研究员、中国科学院院士、第三世界科学院院士
学历和工作简历:
1982-1986 复旦大学生物系,学士学位
1986-1991 中国科学院昆明动物研究所,博士学位
1992-1995 美国圣地亚哥濒危动物繁殖中心(CRES)分子遗传实验室,博士后研究
1996-2005 中国科学院昆明动物研究所副所长
2003-现在 中国科学院院士,云南大学特聘教授
2005-现在中国科学院昆明动物研究所所长
2007-现在 “遗传资源与进化”国家重点实验室主任
2007.11-现在 第三世界科学院院士
研究方向:
张亚平主要从事分子进化与基因组多样性的研究。工作总体上沿着五个密切相关的研究方向开展,并注意遗传、发育与进化的交叉:分子系统进化研究;分子生态学与保护遗传研究;人类的遗传与进化研究;家养动物的起源与驯化;进化基因组学的研究。
野生动物分子系统学研究 在基因组层次建立可靠的动物系统进化谱系,同时结合物种形态,生态,生物学特性等探讨重要的生物进化问题。开展多物种类群的比较系统地理研究,对重点类群物种进行深入的群体遗传学研究,结合地质演化,探讨相近物种分化、物种形成等科学问题。
动物的群体遗传与保护研究 开展一些濒危物种的群体遗传研究,通过了解这些物种群体演变的历史和发展趋势,为制定科学有效的保护对策提供指导。并检验“遗传多样性贫乏与物种濒危有关”这一影响很大的传统理论。
生命条形码项目 我们参与了国际生命条形码(iBOL)项目,旨在建立高通量的DNA条形码测定技术并以此为基础开展的生物多样性区系调查。
人类的遗传与进化研究 基于DNA信息,重建人类进化的历史,探讨人类重大疾病或重要性状的遗传基础,预测、甄别可能的疾病易感人群,为疾病的预防与控制提供必要的遗传学指导依据。
家养动物的起源与驯化 系统深入地研究东亚对家养动物起源的贡献,探讨起源驯化历史,摸清一些代表性家养动物遗传资源背景。开展从品种起源到性状形成以基因和基因组为基础的系统研究,鉴别与人工选择相关的基因或基因组功能元件,探讨人工选择的机制和意义,为品种改良提供依据。
进化基因组学的研究 研究基因重复后重复拷贝的进化命运,新功能、新信号通路、网络结构的起源进化。结合生存环境、行为特征等,探索基因生死、序列变异、表达调控分化等基因组动态变化与动物适应性进化,及各种进化力量在其间的作用。
在研项目
1. 科技部973项目:中国-喜马拉雅地区生物多样性演变与保护研究 首席科学家:张亚平
2. 中科院知识创新工程重要方向项目:国际生命条形码(iBOL)中国预研 负责人:车静
3. 国家自然科学基金面上项目:林蛙群物种的系统分类、物种形成 负责人:车静
4. 国家自然科学基金面上项目:水体污染对滇池鲫鱼群体遗传结构的影响 负责人:高云
5. 国家基金委创新群体项目:分子进化与进化基因组学 负责人:张亚平
6. NFSC-云南省联合基金:云南及周边地区鸡和猪遗传资源的研究 负责人:张亚平
7. 中科院知识创新工程重要方向项目:重要家养动物的东亚起源 负责人:张亚平
8. 科技部973项目“人工选择与基因组进化”子课题1:家养动物与栽培植物的起源
9. 科技部973项目“人工选择与基因组进化”子课题2:家犬的形态变异与基因组进化
10. 农业部转基因生物新品种培育重大专项:动物品质改良关键基因克隆及功能验证
实验室成员
研究人员(Researchers) 电话:5199030(内线8601)
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姓名
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职称
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研究方向
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张亚平
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研究员
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进化与生物多样性研究
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车静
lilycar{at}163.com
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副研究员
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两栖爬行动物系统进化、生物地理学及群体遗传分化研究
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高云
gaoy{at}mail.kiz.ac.cn
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助理研究员
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从群体遗传学角度研究动物在自然选择及人工选择作用下的快速进化过程中的基因组进化规律
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谢海兵
resian{at}263.net
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助理研究员
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分子进化与比较基因组学
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何静
jing.he060708{at}gmail.com
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助理研究员
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基因重复、丢失、基因转换等遗传变异于生物进化的意义
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王国栋
wanggd1983{at}gmail.com
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助理研究员
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基因家族进化、人工选择
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技术员(Technicians)
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吴世芳
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实验师
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朱春玲
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实验师
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金洁琼
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实验师
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博士后
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黄松
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爬行类分子系统进化,生物地理以及保护遗传学
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李家堂
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树蛙科物种系统地理学和形态适应性进化
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学生5198993(内线8610)
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姓名
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研究方向
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潘卉 panh1982{at}163.com
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中国长寿人群与mtDNA相关性研究
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沈永义 shen_yongyi{at}yahoo.com.cn
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脊椎动物的系统发育,适应性进化,群体遗传
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王文智 wenzhiwang1983{at}yahoo.com.cn
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东亚人群群体遗传学研究
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陈睿ruchen{at}mail.ustc.edu.cn
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家犬的生物多样性的群体遗传学研究
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彭旻晟pengmsh{at}hotmail.com
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东亚人群群体遗传学研究
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吴东东dongdongw86{at}yahoo.com.cn
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生物信息学、群体遗传学研究
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赵勉jane123_we{at}126.com
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东亚人群群体遗传学研究
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王姝妍wangshuyan84{at}sina.com
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鲫鱼遗传多样性的研究
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梁璐704230639{at}qq.com
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脊椎动物的系统发育,适应性进化
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颜芳
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两栖类系统地理学和保护遗传研究
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郝晓丹haoxiaodan1987{at}163.com
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线粒体疾病的遗传基础研究
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孙艳波sunyb_1984{at}163.com
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水生脊椎动物(鱼类,海洋哺乳动物)适应性进化的遗传机制
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周炜帏zhouvv1984{at}yahoo.com.cn
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两栖动物系统进化与群体遗传学
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贺军栋hjd0302030101{at}yahoo.com.cn
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人类遗传疾病的遗传基础
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刘杰kingkong311{at}163.com
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脊椎动物的系统发育,适应性进化
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徐丹xudan1986{at}gmail.com
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曹雪caoxue0628{at}gmail.com
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Nguyen Ngoc Sang
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来自越南,2008年毕业于越南胡志明城市大学,获硕士学位。研究方向为东南亚两栖爬行动物分子系统与群体分化研究。
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近五年发表的代表性文章或出版专著
1. Yao Y.G, Kong QP, Bandelt HJ, Kivisild T, Zhang YP (2002) Phylogeographic differentiation of mitochondrial DNA in Han Chinese. Am. J. Hum. Genet. 70: 635-651.
2. Zhang JZ, Zhang YP, Rosenberg HF (2002) Adaptive Evolution of a Duplicated Pancreatic Ribonuclease Gene in a Leaf-Eating Monkey. Nature Genet. 30: 411-415.
3. Savolainen P, Zhang YP, Luo J, Lundeberg J, Leitner T (2002) Genetic evidence for an East Asian origin of domestic dogs. Science. 298: 1610-1613.
4. Shi P, Zhang JZ, Yang H, Zhang YP (2003) Adaptive diversification of bitter taste receptor genes in mammalian evolution. Mol. Biol. Evol. 20: 805-814.
5. Kong QP, Yao YG, Sun C, Bandelt HJ, Zhu CL, Zhang YP (2003) Phylogeny of East Asian mitochondrial DNA lineages inferred from complete sequences. Am. J. Hum. Genet. 73: 671-676.
6. Li HP, Meng S, Meng Z, Fu YX, Zhang YP (2003) Genetic Diversity and Population History of Golden Monkeys (Rhinopithecus roxellana). Genetics. 164: 269-275.
7. Yu L, Li QW, Ryder OA, Zhang YP (2004) Phylogenetic relationships within mammalian order Carnivora indicated by sequences of two nuclear DNA genes. Mol. Phylogenet. Evol. 33: 694-705.
8. Palanichamy MG, Sun C, Agrawal S, Bandelt HJ, Kong QP, Khan F, Wang CY, Chaudhuri TK, Palla V, Zhang YP (2004) Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India, Based on Complete Sequencing: Implications for the Peopling of South Asia. Am. J. Hum. Genet. 75: 966-978.
9. Li Y, Ye C, Shi P, Zou XJ, Xiao R, Gong YY and Zhang YP (2005) Independent origin of the growth hormone gene family in New World monkeys and Old World monkeys/hominoids. Journal of Molecular Endocrinology 35 (2): 399-409.
10. Chen SY, Su YH, Wu SF, Sha T and Zhang YP (2005) Mitochondrial diversity and phylogeographic structure of Chinese domestic goats. Mol. Phylogen.Evol. 37 (3): 804-814.
11. Shi P, Bielawski JP, Yang H, and Zhang YP (2005) Adaptive diversification of vomeronasal receptor 1 genes in rodents. JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION 60: 566-576.
12. Yu L and Zhang YP (2006) The unusual adaptive expansion of pancreatic ribonuclease gene in Carnivora. Mol Biol Evol 23: 2326-2335.
13. Yu L, Li YW, Ryder OA, Zhang Y (2007) Analysis of complete mitochondrial genome sequences increases phylogenetic resolution of bears (Ursidae), a mammalian family that experienced rapid speciation. BMC Evolutionary Biology 7: 11.
14. Wu GS, Yao YG, Qu KX, Ding ZL, Li H, Palanichamy MG, Duan ZY, Li N, Chen YS, Zhang YP (2007) Population phylogenomic analysis of mitochondrial DNA in wild boars and domestic pigs revealed multiple domestication events in East Asia. Genome Biology 8: R245.
15. Wu DD, Irwin DM Zhang YP (2008) Molecular evolution of the keratin associated protein gene family in mammals, role in the evolution of mammalian hair. BMC Evolutionary Biology 8:241.
16. He F, Wu DD, Kong QP, Zhang YP (2008) Intriguing balancing selection on the intron 5 region of LMBR1 in human population. PLoS One 3: e2948.
17. Xie HB, Irwin DM, Zhang YP (2008) Evolution of conserved secondary structures and their function in transcriptional regulation networks BMC Genomics 9:520.
18. Wu DD, Wang GD, Irwin DM Zhang YP (2009) A profound role for the expansion of trypsin-like serine protease family in the evolution of hematophagy in mosquito. Mol Biol Evol.
19. Li H, Wang CY, Wang JX, Wu GS, Yu P, Yan XY, Chen YG, Zhao LH, Zhang YP (2009) Mutation analysis of a large Chinese pedigree with congenital preaxial polydactyly. Eur J Hum Genet 17: 604-10.
20. Che J, Hu JS, Zhou WW, Murphy RW, Papenfuss TJ, Chen MY, Rao DQ, Li PP, Zhang YP (2009) Phylogeny of the Asian spiny frog tribe Paini (Family Dicroglossidae) sensu Dubois. Mol Phylogenet Evol 50: 59-73.
21. Shen Y, Shi P, Sun YB, Zhang YP (2009) Relaxation of selective constraint on avian mitochondrial DNA following the degeneration of flight ability. Genome Res. 19:1760-5.
22. Yu L, Wang XY, Jin W, Luan PT, Ting N, Zhang YP. Adaptive evolution of digestive RNASE1 genes in leaf-eating monkeys revisited: new insights from 10 additional Colobines. Mol Biol Evol. [In press]
获奖情况
国际奖
2002年 获美国“The Bay Foundation and the Josephine Bay and C. Michael Paul Foundation”的“生物多样性领导奖”(Biodiversity Leadership Awards)。
国内奖
1996 云南省自然科学奖一等奖(猕猴属的分子进化研究)
1997 国家自然科学奖三等奖(中国若干特有珍稀动物类群的细胞与分子进化研究)
2001 云南省自然科学奖三等奖(白化猕猴的培育及其白化遗传机制的研究)
2004 中国青年五四奖章
2004 生命科学创新奖(全球华人生物科学家大会)
2004 何梁何利基金科学与技术进步奖。
2005 云南省科学技术突出贡献奖
2006 国家自然科学奖二等奖 (线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究)
2006 长江学者成就奖一等奖